יעוץ ארגוני בגישת הצופן הביוגרפי נשען על ההתבוננות בארגון כמערכת פתוחה הפועל בעידן של אי ודאות, ומוסיף את ההכרה בארגון כישות ביוגרפית. ישות שלמה שיש לה סיפור משלה, ישות שיש לה הסטוריה ועתיד המצטרפים להתנהלות הקיימת בהווה, ישות אורגאנית המתפתחת בשלבים ברורים, בדומה לישות האנושית. הישות הארגונית הינה ישות המורכבת מכלל המערכות התיפקודיות והאנשים המרכיבים אותה, ממאפייני הקשרים ביניהם והתפקידים שלהם ביחס לגוף הארגוני השלם. זו ישות שבה קשרי הגומלין בין המערכות השונות הינם קריטיים למידת הצלחה וההתקדמות של הארגון לכיוון אליו הוא שואף להגיע.

בגישת הצופן הביוגרפי מערכות היחסים בין הפונקציות השונות בארגון הן כר משמעותי לצמיחה דרך הקונפליקטים ואי ההסכמות. הקונפליקטים מהווים הזדמנות לבחינה של התהליכים, התכנים, הגבולות הארגוניים הפנימיים והחיצוניים.
התייחסות לארגון כישות ביוגרפית מאפשרת הבנה עמוקה יותר של התהליכים, היחסים, ההחלטות והניהול בתוך הגוף הארגוני.